Uma empresa nova, do simples nacional, que acabou de adquirir o certificado digital E-CNPJ e precisa emitir DANFE. Ela tem que ter um programa para emitir ou consegue fazê-lo com o certificado digital?
Ela poderá baixar o programa abaixo:
Emissor de NF-e
O Emissor NF-e é um software desenvolvido pela SEFAZ-SP. 
Dúvidas e reclamações devem ser encaminhadas para a Secretaria de Fazenda de São Paulo.

Software Emissor de NFe

Versão de Teste
Versão de Produção (com validade jurídica)
Manuais 
No site da nfe nacional?
Como faz para emitir a nota?